Pénis de conformation normale, dont la longueur dorsale à la naissance à terme est inférieure à 25mm , la mesure étant prise après désenfouissement de la verge de la base du pénis à l'extrémité du gland, et pas du prépuce.
L'examen des organes génitaux externes recherche une cryptorchidie uni ou bilatérale, apprécie le volume testiculaire, l'aspect du scrotum, recherche une anomalie de la ligne médiane associée, ou toute autre anomalie évocatrice d'un syndrome malformatif associé. Attention aux situations d'hypoglycémies récurrentes associées évocatrices d'un déficit en GH.
Le micropénis est le plus souvent idiopathique ou en relation avec un déficit gonadotrope.